Die Universität Hohenheim gliedert sich in drei Fakultäten: Agrarwissenschaften, Naturwissenschaften und Wirtschafts- und Sozialwissenschaften.
Jede Fakultät bezeichnet eine Gruppe zusammengehörender Institute und Fachgebiete. Sie ist als Lehr- und Verwaltungseinheit für die Organisation von Forschung, Lehre und Studium ihres Wissenschaftsbereichs zuständig. An ihrer Spitze steht der Dekan, der für die Fakultätsentwicklung verantwortlich ist.